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Dernière mise à jour : Mai 2018

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AgroBRC - RARe Ressources agronomiques pour la Recherche

Journée scientifique RARe MICROBIOTE, jeudi 10 décembre

@Violaine Rochet INRAE
La journée RARe Microbiote est un événement lancé par la communauté des Centres de ressources biologiques pour la recherche agronomique rassemblés dans l’infrastructure RARe. Cette première journée sera consacrée aux questions liées à la conservation des microbiotes/microbiomes et aux méthodes disponibles pour l’évaluer.

Les journées d’animation RARe identifient des thèmes porteurs pour la communauté scientifique qui impactent les activités des CRB. Elles visent à rassembler les acteurs de RARe autour de ces thèmes communs et de communiquer auprès des équipes scientifiques sur les enjeux associés à la bonne gestion des ressources biologiques et sur l’appui que les CRB de RARe peuvent apporter pour en assurer la traçabilité, la pérennité, la distribution et favoriser leur valorisation.

Vision des thématiques microbiotes dans lesquelles des CRB de RARe sont impliqués

Animé par Michel-Yves Mistou (Pilier microbien, Coordination du CIRM)

Focus sur la conservation des microbiotes et les méthodes pour l’évaluer

10h-10h35 - Conférence Introductive (vocabulaires, enjeux, métaprogramme Holoflux)  

  • Emmanuelle Maguin (Dpt MICA, MICALIS)

10h35-12h30 - Présentations - implication des CRB de RARe dans des projets microbiotes 20+5min

  • Samuel Mondy (pilier Environnement, GenoSol, Agroécologie) : la plateforme GenoSol
  • Perrine Portier (pilier Plantes et microbien, CIRM-CFBP,IRHS) : Projet Microstore : Evaluation des biais de la conservation sur la structure génétique et les capacités métaboliques des communautés.
  • Pause
  • Florence Valence (pilier microbien, STLO CIMR BIA) : le projet de sciences participatives Flegme : le microbiote fermentaire des légumes.
  • Jordi Estelle-Fabrellas (pilier animal, GABI / @BRIDGe) Implantation du microbiote intestinal chez le porc : dynamique et liens avec la robustesse au sevrage.

Présentations - sujets transversaux

13h30-14h30

  •  Christian Morabito (pilier microbien, MGP SAMBO) : Ring-test & évaluation des méthodes Metabarcodind 16S & shotgun 
  •  Philippe Langella (MICALIS) : Structuration de la culturomique à INRAE à travers le projet MWD

Table ronde - proposition de contenu - idées

14h30-15h30

  • Synthèse à chaud
  • Les inconnues de la conservation des échantillons complexes
  • Méthodes d’évaluation des techniques de conservation des échantillons complexes
  • Possibilité de construction de projets transversaux  inter-piliers RARe sur les questions relevant de la conservation/composition des communautés microbiennes – Guichet ?
  • Quels rôles pour les CRBs dans la conservation et la distribution des microbiotes
  • Rôle de RARe pour rassembler et partager les retours d’expérience
  • Rôle de Rare pour favoriser une harmonisation des meilleures pratiques

 

- Dispositif technique Webinar
  • Zoom / Micro coupés / Question et Modération par le chat.
- Formalités d'inscription en ligne

Pour participer, l'inscription est gratuite mais obligatoire (pour réception des modalités de connexion).